
En 1926 se practicó la primera cirugía cuando ya el Hospital había sido trasladado a los terrenos de laHacienda La Hortua, hoy calle primera entre las avenidas décima y Caracas. Hasta hace pocos años fue el único Hospital Universitario de Bogotá y además el más rentable de Colombia y Latinoamérica.
El Hospital San Juan de Dios, fue cerrado hace 14 años y 8 años para el Instito Materno Infantil, tras ser intervenido por la Superintendencia de Salud el 21 de septiembre de 2001, debido a inviabilidad financiera, dineros que se los comió la Beneficencia de Cundinamarca y comenzó su liquidación bajo la dirección de Ana Karenina Gauna Palencia, como agente liquidador del Hospital San Juan de Dios.

Liquidación irregular
La liquidadora del Hospital San Juan de Dios, Ana Karenina Gauna Palencia, vendió a un particular, de manera irregular terrenos donde funcionaban los parqueaderos del Instituto Materno Infantil, que forman parte del centro hospitalario San Juan de Dios que fueron declarados Patrimonio Cultural de la Nación, desde el año 2002.
La liquidadora tendrá que responder a quién le vendió y por cuánto, porque no lo podía hacer, pues los bienes que son Patrimonio Cultural de la Nación son inembargables, imprescriptibles y no son enajenables.
Adicionalmente, Ana Karenina Gauna Palencia, arrendó los consultorios del Hospital Materno Infantil al Hospital de La Victoria, con pago mensual por parte del Distrito de $220 millones. En ese lugar atendían más de 200 niños diarios y ahora solo atienden 13 ó 15
Igualmente vendió irregularmente un lote al cancerológico del complejo San Juan de Dios, por montos que se desconocen.
Por las acciones realizadas por la liquidadora, varios particulares interpusieron el 11 de junio del 2011, una acción popular, que falló el Juzgado 41 Administrativo del Circuito.
La juez Lilia Aparicio Millán le ordenó, entonces, a la liquidadora suspender todo proceso de liquidación, venta, enajenación o entrega a cualquier título, de todo bien mueble o inmueble de propiedad del centro hospitalario San Juan de Dios.
El futuro del Hospital San Juan de Dios
El alcalde, Gustavo Petro, ha mostrado interés por reabrir el Hospital San Juan de Dios, porque sería el eje de su política de la atención primaria en salud en Bogotá.

Pero, hasta ahora, la Secretaría Distrital de Salud se ha tropezado con unas instalaciones deterioradas, en ruina y ocupadas por ex trabajadores del hospital y otras personas, que necesitan ser arregladas laboralmente y pensionalmente. y que se debe destinar una cuantiosa suma para pagar los salarios y atender la carga pensional de los empleados que nunca fueron indemnizados, ni jubilados, y que la Corte Constitucional, ordeno que el Ministerio de Hacienda debe aportar el 50% de los dineros, el 25% lo debe desembolsar el Departamento de Cundinamarca y la Beneficencia, y el resto el Distrito Capital.
Carlos Augusto Cubillos Romero, Corrección Carlos Eduardo Pineda D.
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